Die Entstehung der Evangelisch-Freikirchlichen Gemeinde Bethel steht in engem Zusammenhang mit der Geschichte des Gesundheitswerks Bethel (bis 2018: Diakoniewerk Bethel Berlin) und vor allem mit der Schwesternschaft der Bethel-Diakonissen. Aus diesem Grund stellen wir einen Teil der Geschichte hier gemeinsam dar. Heute hat die Evangelisch-Freikirchliche Gemeinde Bethel keinen institutionellen Bezug mehr zum Gesundheitswerk Bethel Berlin und seinen Einrichtungen. Bis heute gehören aber einige Mitarbeiter des Werks und seiner Arbeitsfelder und die meisten Diakonissen der Diakoniegemeinschaft Bethel zu unserer Gemeinde.

1887 entstand die erste Berliner Bethel-Gemeinde in Friedrichshain. Um der großen sozialen Not entgegenzutreten, gründete Prediger Eduard Scheve das Diakonissenhaus "Bethel".
1891 wurde die erste Außenstelle "Bethels" in Hannover eröffnet, in den folgenden Jahren begannen diakonische Projekte in vielen Orten, u.a. in Königsberg, Zürich, Buckow, Berlin-Schöneberg, Neuruppin, Halle/Saale.
1897 Seit diesem Jahr arbeiten Bethel-Diakonissen in Asien und Afrika.
1945 Im 2. Weltkrieg werden verschiedene Einrichtungen Bethels zerstört. Arbeitsfelder in Ostpreußen und in der DDR müssen aufgegeben werden. Bethel verlagert den Schwerpunkt in den süddeutschen Raum.
1959 Einweihung des Krankenhauses Bethel in Berlin-Lichterfelde. Die Diakonissen feiern Gottesdienste im Krankenhausfoyer.
1964 Einweihung der Evangelisch-Freikirchlichen Gemeinde Bethel am Krankenhaus Bethel, Marienplatz 1, 12207 Berlin (Lichterfelde-Ost) In den Folgejahren wächst die unter anderem von Diakonissen der Diakoniegemeinschaft Bethel gegründete Gemeinde kontinuierlich.
1986 Gründung des „Kindergarten Bethel e.V.“ durch die Gemeinde und engagierte Eltern. Seit April 2012 heißt er "Christlicher Kindergarten Schatzinsel e.V." und hat seine Adresse in der Schillerstraße 24, ganz in der Nähe der Gemeinde.

1988 stellt die Gemeinde Beate Bockemühl als Gemeindediakonin an
2008 Erwerb und Umzug in ein eigenes Kirchengebäude in der Schillerstraße 26 in 12207 Berlin (Lichterfelde-Ost)
2011/2012 Es ist ein schöner Erweiterungs-Anbau mit viel mehr Raum entstanden.
Seit dem Jahr 2011 ist Volker Bohle Pastor der Gemeinde.
Seit 2013 besteht eine Partnerschaft mit der Jerusalem Baptist Church in Blantyre/Malawi
Im Jahr 2015 wird das Taufbecken im Garten errichtet. Damit ist die EFG Bethel die einzige Baptistengemeinde Deutschlands mit einem Außentaufbecken.
2017 Neue Akustikanlage eingeweiht - der Ton stimmt wieder
2020-2022 Während der Pandemie werden 2 Gottesdienste gefeiert
September 2024 Die neue Homepage ist online.